Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms