Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms