Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms