Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms