Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms