Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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C2orf48Q96LS8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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