Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTP4Q96DX8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms