Protein–RNA interactions for Protein: Q969X1

TMBIM1, Protein lifeguard 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM1Q969X1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMBIM1Q969X1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMBIM1Q969X1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMBIM1Q969X1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMBIM1Q969X1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMBIM1Q969X1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMBIM1Q969X1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMBIM1Q969X1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms