Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-CQ95604 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms