Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms