Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms