Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ZNF248Q8NDW4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ZNF248Q8NDW4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ZNF248Q8NDW4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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