Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms