Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms