Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms