Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms