Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms