Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC9A4Q6AI14 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms