Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms