Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms