Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP170Q5SW79 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms