Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNT1Q5JUK3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms