Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCTE1Q5JU00 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.4 ms