Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms