Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms