Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms