Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms