Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms