Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWISTNBQ3B726 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms