Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
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