Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FXNQ16595 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FXNQ16595 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FXNQ16595 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FXNQ16595 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FXNQ16595 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FXNQ16595 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FXNQ16595 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FXNQ16595 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FXNQ16595 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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