Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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