Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms