Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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