Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms