Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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