Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf61Q13536 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms