Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SP140Q13342 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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