Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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