Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CDH17Q12864 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CDH17Q12864 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CDH17Q12864 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CDH17Q12864 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDH17Q12864 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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