Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms