Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC173Q0VFZ6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms