Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms