Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms