Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms