Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 IRAK4-202ENST00000440781 1409 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms