Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms