Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK6Q00534 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms