Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JAG1P78504 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JAG1P78504 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JAG1P78504 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
JAG1P78504 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms