Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFM1P61960 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms